home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00781 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  1.9 KB  |  40 lines
  1. *********************************************
  2. * ADP-ribosylation factors family signature *
  3. *********************************************
  4.  
  5. ADP-ribosylation factors (ARF) [1,2]   are 20 Kd GTP-binding proteins involved
  6. in protein trafficking. They may modulate vesicle budding and uncoating within
  7. the Golgi apparatus.   ARFs also  acts  as  an allosteric activator of cholera
  8. toxin  ADP-ribosyltransferase activity.  ARFs  are  evolutionary conserved and
  9. present in all eukaryotes.  At  least  six forms of ARF are present in mammals
  10. and two  are  present in budding yeast.  The ARF family also includes proteins
  11. highly related  to  ARFs  but  which lack the cholera toxin cofactor activity,
  12. these proteins are collectively known as ARLs (ARF-like).
  13.  
  14. ARD1 is a 64 kd mammalian protein of unknown biological function that contains
  15. an ARF domain at its C-terminal extremity.
  16.  
  17. Proteins from the ARF family  are generally included in the RAS superfamily of
  18. small GTP-binding protein, but they are only slightly related to the other RAS
  19. proteins.  They also  differ  from RAS  proteins in  that they  lack  cysteine
  20. residues at  their  C-termini and are therefore not subject to prenylation and
  21. that they are generally N-terminally myristoylated.
  22.  
  23. As a  signature  pattern we selected a conserved region in the C-terminal part
  24. of ARFs and ARLs.
  25.  
  26. -Consensus pattern: [HR]-x-[FYW]-x-[LIVM]-x(4)-A-x(2)-G-x(2)-[LIVM]-x(2)-
  27.                     [GSA]-[LIVM]-x-W-[LIVM]
  28. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  29. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  30.  
  31. -Note: the  proteins  belonging  to  this  family  also  contain a copy of the
  32.  ATP/GTP-binding motif A (see the relevant section).
  33.  
  34. -Last update: June 1994 / First entry.
  35.  
  36. [ 1] Moss J., Vaughan M.
  37.      Cell. Signal. 4.367-399(1993).
  38. [ 2] Moss J., Vaughan M.
  39.      Prog. Nucleic Acid Res. Mol. Biol. 45:47-65(1993).
  40.